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依據區域計畫法第15條規定，區域計畫公告實施後，不屬第11條之非都市土地，應由有關直轄市或縣（市）政府，按照非都市土地使用分區計畫，製定非都市土地使用分區圖，並編定各種使用地，報經上級主管機關核備後，實施管制。

為協助直轄市、縣（市）政府辦理非都市土地資源型使用分區更正、劃定或檢討變更，及銜接未來編定管制業務，本署召開「非都市土地編定管制協調會報」督導並協助直轄市、縣（市）政府辦理相關事務。

本部於106年5月16日公告實施「修正全國區域計畫」，直轄市、縣（市）政府應依該計畫及依據作業須知規定，辦理特定農業區及一般農業區檢討變更案件，並應於前開計畫或直轄市、縣（市）區域計畫公告實施後6個月內函送本部，且直轄市、縣（市）政府函送案件應同時包含檢討變更為特定農業區及一般農業區等二類案件，並以全市（縣）一次性辦理為原則。

本署於105年辦理「委託辦理非都市土地特定農業區及一般農業區檢討變更先期規劃」案，提出特定農業區及一般農業區檢討變更方案及辦理程序初步構想，並研擬相關配套機制，以協助直轄市、縣(市)政府辦理相關作業。

各直轄市、縣（市）特定農業區及一般農業區檢討變更案件進度如下：

一、非都市土地一定規模以上特定目的事業用地及遊憩用地檢討變更為特定專用區作業工作手冊(11202修正版)

二、非都市土地特定農業區及一般農業區檢討變更作業

（一）非都市土地特定農業區及一般農業區檢討變更作業工作手冊（作業手冊）。

（二）特定農業區及一般農業區檢討變更檢討變更作業辦理程序及查核項目（107.08.17函文）。

（三）特定農業區及一般農業區檢討變更檢討變更作業，函報本部核備及補正期限事宜（108.09.25函文）。