有關聯合報社論質疑廢礦區檢討作業是削足適履、獨厚權貴的方式，國土管理署嚴正澄清，本次檢討是通案處理全國廢礦礦業用地回復居住權，共分布於新北市、基隆市、桃園市、新竹縣、苗栗縣及南投縣等6縣市、約343公頃，並非只針對個案。
原民土地和廢礦區均是保障民眾既有居住權
有關外界質疑廢礦區既非原鄉，亦非原住民，為何比照「北泰雅原住民族特定區域計畫」1節，國土管理署說明，廢礦區只是參採該特定區域計畫對於建築物範圍認定的時間點，因無論是原住民族土地或廢礦區檢討，都是為了保障民眾既有居住權益，因此採用相同的認定時間，和計畫對象是否為原住民無關。
水金地區已朝向觀光與商業發展，偏離原來居住使用，市府應整體空間規劃
另對於瑞芳水湳洞、金瓜石地區的問題，國土管理署遺憾表示，新北市政府一再用錯誤資訊引發民眾疑慮，因水金地區範圍完整、面積約303公頃，現況使用樣態眾多，主要為遊憩、餐廳、民宿營利用途，與本次廢礦區檢討主要保障居住權之本質不同，應由新北市政府考量水金地區整體發展需求，研擬空間計畫，以引導土地適性利用，實質解決當地觀光產業發展需求。國土管理署已於111年補助新北市政府辦理瑞芳區鄉村地區整體規劃作業，但市府並未將該議題納入處理。
中央已提出通案處理原則，縣市政府可辦理檢討變更作業
就聯合報社論所提解方，國土管理署回應，礦區建物是因在廢礦時政府未能即時將分區進行更正，造成民眾喪失合法房屋權益，與過去違建概念不同，國土管理署已依據區域計畫法相關規定，和經濟部地礦中心共同提出通案處理原則，請有類此情形的縣市政府依規定辦理檢討作業，國土管理署將適時提供必要協助。
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